с. Амур, с. Абай, п. Красноярка, п. Улужай, с. Юстик, с. Верх-Уймон, п. Гагарка, п. Замульта, с. Маральник-1, с. Мульта, с. Тихонькая с. Горбуново, п. Октябрьское, п. Теректа, с. Карагай, с. Банное, с. Курдюм, с. Катанда, п. Кучерла, с. Тюнгур, с. Огнёвка, п. Березовка, с. Кайтанак, п. Мараловодка, п. Сахсабай, с. Талда, с. Соузар, с. Сугаш, с. Усть-Кокса, с. Баштала, с. Власьево, с. Кастахта, п. Красноярка, п. Курунда, с. Синий Яр, п. Тюгурюк, с. Чендек, с. Ак-Коба, п. Маральник-2, п. Маргала, с. Нижний Уймон, п. Полеводка
Как административная единица район образовался в 1920 году, в 1923 году это решение было закреплено решением областного съезда Советов. В сентябре 1924 года образован Уймонский аймак. Центр аймака – село Катанда. Согласно протоколу № 75 заседания ВЦИК от 10.04.1933 года Уймонский аймак переименован в Усть-Коксинский, центр аймака перенесен из Катанды в Усть-Коксу.
В 1963 году Указом Верховного Совета РСФСР от 01.02.63 Усть-Коксинский аймак ликвидирован, а его территория отошла к Усть-Канскому аймаку. 14 марта 1963 года Усть-Канский аймак переименован в район. В 1964 году Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 04.03.64 г. был вновь образован Усть-Коксинский район с центром в с. Усть-Кокса.
Муниципальное образование Усть-Коксинский район расположен в юго-западной части Республики Алтай и входит в горно-степную зону Территория - 12958 кв. км. В районе в 42 населенных пункта, входящие в 9 сельских администраций, проживают 16,1 тыс. человек. Районный центр - село Усть-Кокса - основано в 1807 году и находится в 400 км от города Горно-Алтайска .
С запада Усть-Коксинский район граничит с Усть-Канским районом, с севера - с Онгудайским, с востока - с Кош-Агачским районом Республики Алтай, с юга - с Казахстаном.
На территории находится белоснежная гора Белуха, из многочисленных ледников которой берет свое начало Катунь. На территории района расположено 439 озер. Самые крупные: Тайменье, Мультинские, Кучерлинские, Шавлинские. На Катунском хребте расположен 391 ледник с их общей площадью 245 кв.км.
Район характеризуется высоким разнообразием природных зон - степи и межгорные котловины, горная тайга, альпийские и субальпийские луга и вечные снега и ледники. Уникальное сочетание разнообразных ландшафтов района обусловило богатство его флоры и фауны особенно большим разнообразием отличается растительный мир Катунского заповедника. Здесь произрастает около 700 видов растений, из которых более 20 занесены в Красную книгу России и Республики Алтай. В высокогорьях здесь можно встретить в больших количествах золотой корень (радиола розовая), который является обычным видом для этих мест.
В заповеднике обитает 52 вида млекопитающих, 155 видов птиц и 8 видов рыб, в том числе внесенные в Красную книгу РФ снежный барс, черный аист, скопа, балобан, сапсан, беркут, черный гриф.
Село Усть-Кокса расположено в 400 км от города Горно-Алтайска, в 490 км от ближайшей железнодорожной станции - города Бийска. В Усть-Коксинский район можно добраться через Усть-Канского район по дороге, идущей от села Усть-Кан через Кырлыкский перевал до села Тюнгур.